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4D-DIA定量蛋白组

▼ 服务介绍

4D-DIA定量蛋白组


4D蛋白质组学技术在传统的保留时间、质荷比、离子强度的基础上增加了第四维离子淌度的信息,以研究蛋白质的表达水平,由此获得蛋白质水平上关于疾病发生,细胞代谢等过程的整体而全面的认识。


产品介绍:


DIA(Data-independent Acquisition,数据非依赖采集)策略则是将质谱整个全扫描范围分为若干个窗口,并循环地对每个窗口中的所有离子进行选择、碎裂、检测,因此可以无遗漏地获得样本中所有离子的全部碎片信息,缺失值更少。但传统DIA的数据采集策略会使得谱图高度复杂,给数据解析带来极大的挑战,并且其定量可靠性也存有一定的争议。4D-DIA技术借助timsTOF Pro2特有的双TIMS设计和DIA-PASEF®采集模式,检测灵敏度在传统DIA基础得到了提升。由于4D-DIA技术的定量信息比传统DIA多了一维离子淌度信息,使得定量结果更准确,定量可重现性更好。


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4D蛋白组原理示意图



技术优势


(1)覆盖度更深,尽量不丢失蛋白质;
(2)定性更准确,结果可信度高;
(3)更稳定,定量更准确,数据更可靠;
(4)通量高,满足大队列项目;
(5)低样本量,更好满足临床样本少等问题。


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应用方向:


♦ 医学研究
疾病机理机制研究、诊断分子标志物、药物靶点

♦ 动物研究
动物生殖发育机制、动物疾病机理、动物营养代谢与调控、动物毒理研究

♦ 植物研究
植物生殖发育机制、非生物胁迫应答机理、植物抗病机理、作物改良

♦ 微生物
致病机制及耐药性研究 胁迫相关蛋白筛查及机制研究 环境作用机理


样本要求:


适用产品样本类型                                样本推荐送样量最低送样量








4D-DIA定量蛋白组

   

     动物组织

常规组织(心、肝、脾、肺等)50mg
特殊组织(皮肤、毛发、骨头)200mg


     植物组织

幼嫩组织50mg
成熟组织(树皮、根、果实)1g
花粉40mg



        液体

血清/血浆(不去除高丰度蛋白)20uL
唾液/脑脊液/羊水/乳汁200μL
尿液5mL
细胞上清25mL
唾液/脑脊液/羊水/乳汁200μL
外泌体25μL

        细胞

原代细胞3×106
传代细胞1×106
        其他蛋白质50μg

研究结论:


该工作采用了4D-蛋白质组方法,揭示了感染初期免疫抑制和COVID-19患者紧密相关。与早期相比,在感染的后期,免疫反应在一定程度上被激活。这些研究提供了与COVID-19疾病相关的分子变化图谱,并为可能发生的两期发病机制提供了线索。


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